Музей Харківського дитячо-юнацького клубу моряків створений 1 вересня 2005 року з метою військово-патріотичного виховання молодого покоління на прикладах героїчного минулого військово-морського флоту, формування у курсантів клубу почуття поваги до історії та діяльності закладу, до культурної спадщини Харківщини.

В музеї можна побачити більше трьох сотен експонатів. Ці експонати збиралися курсантами клубу та керівниками гуртків. В числі цих експонатів моделі сучасних човнів та човнів часів Великої Вітчизняної війни, стенд «Бойовий шлях лідера «Харків»», стаціонарні виставки «Трагедії на морі», «Легендарний бриг «Меркурій»», зброя флоту, штурманські прилади тощо.